El Instituto Nacional de Astrofísica, Óptica y Electrónica ofrece, desde 1998, estudios de especialidad, maestría y doctorado en Ciencias Computacionales.
 El programa de Maestría en Ciencias Computacionales pertenece al Programa Nacional de Posgrados de Calidad (PNPC) del CONACYT, nivel Consolidado, y el Doctorado en Ciencias Computacion a nivel Competencia Internacional. 
El nucleo académico consta de 8 con lineas de investigación bien definidas, en el marco dede las Lineas de Generación y Aplicación del Conocimiento (LGAC) del posgrado: 
 

1. Aprendizaje Computacional y Reconocimiento de Patrones

2. Cómputo Reconfigurable y de Alto Desempeño

3. Procesamiento de Bio-Señales y Computación Médica

4. Cómputo y Procesamiento Ubicuo

5. Robótica

6. Tecnologías del Lenguaje

7. Visión Computacional 

8. Ciberseguridad

Los profesores tienen un sólido compromiso académico con los estudiantes inscritos en los Posgrados de Ciencias Computacionales. El 78.71% de los investigadores pertenece al Sistema Nacional de Investigadores (S.N. I.)